Michael Jackson tuvo su aparición en la serie

En el capítulo «Reinos infinitos» se puede apreciar como Vlad está viendo la televisión y aparece Michael Jackson siendo escoltado por policías, una referencia un poco fuerte.
El origen de Amity Park

El nombre de Amity Park es una deformación del pueblo estadounidense Amityville, lugar que es conocido por un famoso caso de asesinato. En los 80, un hijo mató a toda su familia y desde entonces nadie compra la casa por leyendas urbanas que dicen que hay fantasmas en la residencia.

El asesino es Ronald Joseph, fue juzgado y condenado por los asesinatos en 1974 de su padre, madre, dos hermanos y dos hermanas. El caso es notable por ser la inspiración de la vida real detrás del libro y las versiones en películas de The Amityville Horror.
Referencias a los padrinos

En el episodio «Lo que quieras» se puede ver como Danny está jugando un videojuego de otro personaje de Butch Hartman, Crash Nebula.
Referencias a Volver al Futuro

En el episodio «Una traición al corazón» cuando Gregor está seleccionando un libro aparece una novela ficticia de George McFly, un personaje de Volver al Futuro.
Hombres de Blanco

Los hombres de Blanco son una clara referencia a los Hombres de Negro. Al igual que la Gatita sayonara a Hello Kitty.

El episodio único

El episodio «Reuniones amargas» tiene historia… como el único episodio donde no aparecen Sam y Tucker.
Apariciones obvias

El dos episodios aparecer parodias a Freddy Krueger. Una en «Pesadilla fantasma» y la otra en «Siniestra» . En el poster también podemos apreciar una referencia a Alien.
El cuarto de Sam

En los episodios donde sale el cuarto de Sam se puede apreciar un póster del grupo musical Nine Inch Nails y otro póster de la película La Naranja Mecánica.
Jugando con la competencia

En la serie se mostró una parodio a una popular serie que todos conocemos. Llamaron a la parodia «Los cazafantasmas y el gato miedoso», claramente son una parodia a Scooby Doo.
Butch Hartman haciendo de las suyas

Existe un episodio en Los padrinos mágicos donde los padres de Timmy dicen ser cazafantasmas, aquí se puede ver como en la pantalla aparece Danny Phantom.
Un colega en la serie

El nombre de la escuela «Casper High» es una clara referencia al clásico personaje llamado Casper.

Marvel en Danny Phantom

El personaje Johnny 13 está basado en el personaje de Marvel, Ghost Rider.